Dê preferência pelo terminal.
Fazer o backup de dados importantes é recomendado também, na maioria dos casos nenhum problema ocorre, mas ter o backup é bom se algo der muto errado.
Vamos ao procedimento. Instale o plugin do DNF (pacote dnf-plugin-system-upgrade) com o comando:
sudo dnf install dnf-plugin-system-upgrade
Agora vamos ao processo de upgrade para a versão 39
sudo dnf system-upgrade download –release=39

Responder com s as perguntas sobre continuar com as atualizações.
Terminado a atualizão. Vamos reiniciar para terminar o procedimento:
sudo dnf system-upgrade reboot
Iniciado e pronto para usar.

